Desarrollo mediante ddRADseq y aplicación de nuevos marcadores SSR en pecán para identificación de cultivares

Abstract

Introducción: El pecán (Carya illinoinensis) es una especie con una amplia distribución natural, adaptada a diversos ambientes y climas. Presenta una floración diclino monoica con dicogamia, es decir que las flores femeninas y masculinas de una misma variedad y dispuestas sobre un mismo pie no maduran al mismo tiempo. Esta característica hace que la productividad del cultivo dependa de la correcta combinación de cultivares dado por el período de liberación de polen y receptividad del estigma de cada uno. Los cultivares de pecán se propagan agámicamente mediante multiplicación por injertos. Por lo que, en este contexto, la identificación temprana y trazabilidad de los cultivares es clave para la generación de plantaciones productivas viables. En Argentina, el INTA cuenta con 20 cultivares registrados (https://gestion.inase.gob.ar/registroCultivares/publico/catalogo) que fueron introducidos desde el ARS-USDA Pecan Breeding Program en 2009 y dispone de un sistema de marcadores microsatélites (SSR) para la identificación inequívoca y trazabilidad de estos, ofrecido como servicio a viveros y productores. Debido a la circulación de otros cultivares no inscriptos, se requirió del desarrollo de nuevos marcadores que permitan evaluar esta nueva situación. En la actualidad, las técnicas de generación de bibliotecas de representación de genoma reducido, como ddRADseq (double digest Restriction Site Associated DNA Sequencing), permiten la detección y evaluación de SSR polimórficos y facilitan el desarrollo de oligonucleótidos para amplificaciones específicas posteriores.