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Abstract
Background: Asian soybean rust (SBR) caused by Phakopsora pachyrhizi Syd. & Syd., is one of the main diseases affecting soybean and has been reported as one of the most economically important fungal pathogens worldwide. Knowledge of the genetic diversity of this fungus should be considered when developing resistance breeding strategies. We aimed to analyze the genetic diversity of P. pachyrhizi combining simple sampling with a powerful and reproducible [ver mas...]
dc.contributor.authorRocha, Carla Maria Lourdes
dc.contributor.authorVellicce, Gabriel Ricardo
dc.contributor.authorGarcia, Maria Gabriela
dc.contributor.authorPardo, Esteban Mariano
dc.contributor.authorRacedo, Josefina
dc.contributor.authorPerera, María Francisca
dc.contributor.authorDe Lucia, Adrían Darío
dc.contributor.authorGilli, Javier Ramon
dc.contributor.authorBogado, Noelia
dc.contributor.authorBonnecarrére, Victoria
dc.contributor.authorGerman, Silvia
dc.contributor.authorMarcelino, Francismar
dc.contributor.authorLedesma, Fernando
dc.contributor.authorReznikov, Sebastian
dc.contributor.authorPloper, Leonardo Daniel
dc.contributor.authorWelin, Bjorn
dc.contributor.authorCastagnaro, Atilio Pedro
dc.date.accessioned2018-07-04T13:42:05Z
dc.date.available2018-07-04T13:42:05Z
dc.date.issued2015-11
dc.identifier.issn0717-3458
dc.identifier.otherhttps://doi.org/10.1016/j.ejbt.2015.06.007
dc.identifier.urihttps://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0717345815001268
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.12123/2721
dc.description.abstractBackground: Asian soybean rust (SBR) caused by Phakopsora pachyrhizi Syd. & Syd., is one of the main diseases affecting soybean and has been reported as one of the most economically important fungal pathogens worldwide. Knowledge of the genetic diversity of this fungus should be considered when developing resistance breeding strategies. We aimed to analyze the genetic diversity of P. pachyrhizi combining simple sampling with a powerful and reproducible molecular technique. Results: We employed Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) technique for the amplification of P. pachyrhizi DNA extracted from naturally SBR-infected plants from 23 production fields. From a total of 1919 markers obtained, 77% were polymorphic. The high percentage of polymorphism and the Nei's genetic diversity coefficient (0.22) indicated high pathogen diversity. Analysis of molecular variance showed higher genetic variation within countries than among them. Temporal analysis showed a higher genetic variation within a year than between years. Cluster, phylogenetic and principal co-ordinate analysis showed that samples group by year of collection and then by country sampled. Conclusions: The study proposed combining a simple collection of urediniospore with a subsequent analysis by AFLP was useful to examine the molecular polymorphism of samples of P. pachyrhizi collected and might have a significant contribution to the knowledge of its genetic diversity. Also, AFLP analysis is an important and potent molecular tool for the study of genetic diversity and could be useful to carry out wider genetic diversity studies.eng
dc.formatapplication/pdfes_AR
dc.language.isoenges_AR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesses_AR
dc.sourceElectronic Journal of Biotechnology 18 (6) : 439-444 (November 2015)es_AR
dc.subjectPhakopsora pachyrhizies_AR
dc.subjectPolimorfismo de Longitud de Fragmentos Amplificadoses_AR
dc.subjectAmplified Fragment Length Polymorphismeng
dc.subjectMarcadores Genéticoses_AR
dc.subjectGenetic Markerseng
dc.subjectSojaes_AR
dc.subjectSoybeanseng
dc.subjectVariación Genéticaes_AR
dc.subjectGenetic Variationeng
dc.subject.otherAFLPes_AR
dc.subject.otherMarcadores Moleculareses_AR
dc.titleUse of AFLP markers to estimate molecular diversity of Phakopsora pachyrhizies_AR
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/artículoes_AR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/articlees_AR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersiones_AR
dc.description.origenEEA Cerro Azules_AR
dc.description.filFil: Rocha, Carla Maria Lourdes. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Vellicce, Gabriel Ricardo. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Garcia, Maria Gabriela. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Pardo, Esteban Mariano. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Racedo, Josefina. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Perera, María Francisca. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: De Lucia, Adrían Darío. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Cerro Azul; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Gilli, Javier Ramon. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Bogado, Noelia. Instituto Paraguayo de Tecnología Agraria. Centro de Investigación Capitán Miranda; Paraguayes_AR
dc.description.filFil: Bonnecarrère, Victoria. Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria. Estación Experimental Wilson Ferreira Aldunate. Unidad de Biotecnología; Uruguayes_AR
dc.description.filFil: German, Silvia. Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria. Estación Experimental Wilson Ferreira Aldunate. Unidad de Biotecnología; Uruguayes_AR
dc.description.filFil: Marcelino, Francismar. Empresa Brasilera de Pesquisa Agropecuaria (Embrapa). Soja; Brasiles_AR
dc.description.filFil: Ledesma, Fernando. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Reznikov, Sebastian. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Ploper, Leonardo Daniel. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Welin, Bjorn. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Castagnaro, Atilio Pedro. Gobierno de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentinaes_AR
dc.subtypecientifico


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