Primer reporte de Allium deltapartitivirus en cebolla en Argentina

Abstract

El género Deltapartitivirus comprende virus dsRNA compuesto por dos o tres segmentos genómicos y encapsidados individualmente. Causan infecciones persistentes que se transmiten por semilla. Se desconoce los síntomas causados por estos virus, pero podrían desempeñar un papel en el complejo viral asociado a enfermedades, mientras que otros podrían mostrar efectos beneficiosos al expresarse como genes funcionales en plantas. Para el estudio actual, se propuso identificar secuencias virales en conjuntos de datos transcriptómicos obtenidos en años anteriores. Utilizando herramienta de mapeo contra bases de datos Roche 454 y Illumina HiSeq 1500 de una muestra de cebolla, se encontraron lecturas que mapearon contra los 3 segmentos genómicos del Allium deltapartitivirus: de 571nt, 101nt y 174nt contra el RNA1, de 307nt, 183nt, 62nt y 159nt contra el RNA2 y de 623nt contra el RNA3, con identidad de nt que varió de 91,2% a 100%. Este resultado confirmó la detección del Allium deltapartitivirus y es el primer reporte del virus en Argentina.