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Abstract
Sclerotinia head rot (SHR), caused by the necrotrophic fungus Sclerotinia sclerotiorum, is one of the most devastating sunflower crop diseases. Despite its worldwide occurrence, the genetic determinants of plant resistance are still largely unknown. Here, we investigated the Sclerotinia-sunflower pathosystem by analysing temporal changes in gene expression in one susceptible and two tolerant inbred lines (IL) inoculated with the pathogen under field [ver mas...]
dc.contributor.authorFass, Monica Irina
dc.contributor.authorRivarola, Maximo Lisandro
dc.contributor.authorEhrenbolger, Guillermo Federico
dc.contributor.authorMaringolo, Carla Andrea
dc.contributor.authorMontecchia, Juan Francisco
dc.contributor.authorQuiroz, Facundo Jose
dc.contributor.authorGarcía‑García, Francisco
dc.contributor.authorDopazo Blázquez, Joaquín
dc.contributor.authorHopp, Horacio Esteban
dc.contributor.authorHeinz, Ruth Amelia
dc.contributor.authorPaniego, Norma Beatriz
dc.contributor.authorLia, Veronica Viviana
dc.date.accessioned2020-09-17T16:59:34Z
dc.date.available2020-09-17T16:59:34Z
dc.date.issued2020-08
dc.identifier.issn2045-2322
dc.identifier.otherhttps://doi.org/10.1038/s41598-020-70315-4
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.12123/7921
dc.identifier.urihttps://www.nature.com/articles/s41598-020-70315-4
dc.description.abstractSclerotinia head rot (SHR), caused by the necrotrophic fungus Sclerotinia sclerotiorum, is one of the most devastating sunflower crop diseases. Despite its worldwide occurrence, the genetic determinants of plant resistance are still largely unknown. Here, we investigated the Sclerotinia-sunflower pathosystem by analysing temporal changes in gene expression in one susceptible and two tolerant inbred lines (IL) inoculated with the pathogen under field conditions. Differential expression analysis showed little overlapping among ILs, suggesting genotype-specific control of cell defense responses possibly related to differences in disease resistance strategies. Functional enrichment assessments yielded a similar pattern. However, all three ILs altered the expression of genes involved in the cellular redox state and cell wall remodeling, in agreement with current knowledge about the initiation of plant immune responses. Remarkably, the over-representation of long non-coding RNAs (lncRNA) was another common feature among ILs. Our findings highlight the diversity of transcriptional responses to SHR within sunflower breeding lines and provide evidence of lncRNAs playing a significant role at early stages of defense.eng
dc.formatapplication/pdfes_AR
dc.language.isoenges_AR
dc.publisherSpringer Naturees_AR
dc.relationinfo:eu-repograntAgreement/INTA/PNBIO-1131022/AR./Genómica funcional y biología de sistemas.es_AR
dc.relationinfo:eu-repograntAgreement/INTA/PNBIO-1131043/AR./Bioinformática y Estadística Genómica.es_AR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesses_AR
dc.sourceScientific Reports 10 : 13347 (Agosto 2020)es_AR
dc.subjectHelianthus annuuses_AR
dc.subjectSclerotinia sclerotiorumes_AR
dc.subjectGene Expressioneng
dc.subjectExpresión Génicaes_AR
dc.subjectImmune Responseeng
dc.subjectRespuesta Inmunológicaes_AR
dc.subjectDefense Mechanismseng
dc.subjectMecanismo de Defensaes_AR
dc.subjectRNA Sequenceeng
dc.subjectSecuencia de ARNes_AR
dc.titleExploring sunflower responses to Sclerotinia head rot at early stages of infection using RNA‑seq analysises_AR
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/artículoes_AR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/articlees_AR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersiones_AR
dc.description.origenInstituto de Biotecnologíaes_AR
dc.description.filFil: Fass, Mónica Irina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Rivarola, Maximo Lisandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Ehrenbolger, Guillermo Federico. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Maringolo, Carla Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Laboratorio de Patología Vegetal; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Montecchia, Juan Francisco. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Quiroz, Facundo Jose. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Laboratorio de Patología Vegetal; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: García‑García, Francisco. Principe Felipe Research Center. Bioinfomatics and Biostatistics Unit; Españaes_AR
dc.description.filFil: Dopazo Blázquez, Joaquín. Fundación Progreso y Salud (FPS). Clinical Bioinformatics Area; Españaes_AR
dc.description.filFil: Hopp, Horacio Esteban. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Heinz, Ruth Amelia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Paniego, Norma Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Lia, Veronica Viviana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.subtypecientifico


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