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Resumen
Cercospora kikuchii (Tak. Matsumoto & Tomoy.) M.W. Gardner 1927 is an ascomycete fungal pathogen that causes Cercospora leaf blight and purple seed stain on soybean. Here, we report the first draft genome sequence and assembly of this pathogen. The C. kikuchii strain ARG_18_001 was isolated from soybean purple seed collected from San Pedro, Buenos Aires, Argentina, during the 2018 harvest. The genome was sequenced using a 2 × 150 bp paired-end method by [ver mas...]
dc.contributor.authorSautua, Francisco José
dc.contributor.authorGonzalez, Sergio Alberto
dc.contributor.authorDoyle, Vinson P.
dc.contributor.authorBerretta, Marcelo Facundo
dc.contributor.authorGordó, Manuela
dc.contributor.authorScandiani, María Mercedes
dc.contributor.authorRivarola, Maximo Lisandro
dc.contributor.authorFernandez, Paula Del Carmen
dc.contributor.authorCarmona, Marcelo Anibal
dc.date.accessioned2020-01-08T17:54:04Z
dc.date.available2020-01-08T17:54:04Z
dc.date.issued2019-10
dc.identifier.issn2352-3409
dc.identifier.otherhttps://doi.org/10.1016/j.dib.2019.104693
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.12123/6638
dc.identifier.urihttps://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352340919310480
dc.description.abstractCercospora kikuchii (Tak. Matsumoto & Tomoy.) M.W. Gardner 1927 is an ascomycete fungal pathogen that causes Cercospora leaf blight and purple seed stain on soybean. Here, we report the first draft genome sequence and assembly of this pathogen. The C. kikuchii strain ARG_18_001 was isolated from soybean purple seed collected from San Pedro, Buenos Aires, Argentina, during the 2018 harvest. The genome was sequenced using a 2 × 150 bp paired-end method by Illumina NovaSeq 6000. The C. kikuchii protein-coding genes were predicted using FunGAP (Fungal Genome Annotation Pipeline). The draft genome assembly was 33.1 Mb in size with a GC-content of 53%. The gene prediction resulted in 14,856 gene models/14,721 protein coding genes. Genomic data of C. kikuchii presented here will be a useful resource for future studies of this pathosystem. The data can be accessed at GenBank under the accession number VTAY00000000 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/VTAY00000000.eng
dc.formatapplication/pdfes_AR
dc.language.isoenges_AR
dc.publisherElsevieres_AR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesses_AR
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
dc.sourceData in brief 27: 104693 (Octubre 2019)es_AR
dc.subjectCercospora kikuchiies_AR
dc.subjectGenomeseng
dc.subjectGenomases_AR
dc.subjectNucleotide Sequenceeng
dc.subjectSecuencia Nucleotídicaes_AR
dc.subjectSoybeanseng
dc.subjectSojaes_AR
dc.subjectBioinformaticseng
dc.subjectBioinformáticaes_AR
dc.subject.otherPhylogenetic Analyseseng
dc.subject.otherAnálisis Filogenéticoes_AR
dc.subject.otherPurple Seed Staineng
dc.subject.otherMancha Púrpura de la Semillaes_AR
dc.titleDraft genome sequence data of Cercospora kikuchii, a causal agent of Cercospora leaf blight and purple seed stain of soybeanses_AR
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/artículoes_AR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/articlees_AR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersiones_AR
dc.rights.licenseCreative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)
dc.description.origenInstituto de Biotecnologíaes_AR
dc.description.filFil: Sautua, Francisco José. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Cátedra de Fitopatología; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Gonzalez, Sergio Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Doyle, Vinson P. LSU AgCenter. Department of Plant Pathology and Crop Physiology; Estados Unidoses_AR
dc.description.filFil: Berretta, Marcelo Facundo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Microbiología y Zoología Agrícola; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Gordó, Manuela. Laboratorio Agrícola Río Parana; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Scandiani, Mercedes M. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmac euticas. Centro de Referencia de Micología (CEREMIC); Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Rivarola, Maximo Lisandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Fernandez, Paula Del Carmen. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Carmona, Marcelo Anibal. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Cátedra de Fitopatología; Argentinaes_AR
dc.subtypecientifico


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