Hacia el desarrollo de durazneros con menor incidencia de CAROZO PARTIDO: Identificación de QTL y genes candidatos mediante GWAS en una campaña

Abstract

Los durazneros presentan un endocarpio leñoso protegiendo la semilla e incide un desorden fisiológico denominado carozo partido (CP). Los daños pueden alcanzar hasta un 50 % de los frutos cosechados como la semilla expuesta y frutos deformes. Se han propuestos genes con dominio MADSbox, aunque el control genético no se ha descrito. El objetivo consistió en el estudio del control genético de CP en una primera campaña. La EEA San Pedro cuenta con 200 accesiones en un banco de germoplasma que fueron genotipificadas con 14054 variantes polimórficas cada una. Durante la campaña 2023/2024 se midió la variable: CP (%). Se realizó un estudio de asociación (GWAS) usando el software R y el paquete estadístico GAPIT3. Posteriormente, mediante un análisis de BLAST contra la versión Prunus persica Genomev2.0.a1, se identificaron los genes presentes en la región de interés. Se analizó una región de 123621 pb correspondiente al haplobloque que contiene los marcadores significativos para identificar genes candidatos. Como resultado del estudio, se identificó un QTL que controlaría un 14% la expresión de CP ubicado en el cromosoma 4 y asociado significativamente (LOD: 6.03). Dentro de la región, se determinaron genes que codifican proteínas AGAMOUS con dominio MADSbox y Kbox con actividad reguladora de la expresión de otros genes e implicados en el desarrollo del fruto. Además, el marcador molecular de mayor asociación se encuentra inserto en un conjunto de genes colocalizados, pudiendo tener efectos sobre la funcionalidad del mismo. Se detectó la presencia de una variante alélica presente cuando hay casos de CP. En conclusión, se logró identificar la ubicación de un marcador ligado a CP, no descrito con anterioridad y resulta un marcador prometedor para incluir en programas de mejora. Nuestros resultados suman evidencias de la implicancia de genes candidatos en la determinación del caracter CP.