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Abstract
Background: Leaf senescence is a complex process, controlled by multiple genetic and environmental variables. In sunflower, leaf senescence is triggered abruptly following anthesis thereby limiting the capacity of plants to keep their green leaf area during grain filling, which subsequently has a strong impact on crop yield. Recently, we performed a selection of contrasting sunflower inbred lines for the progress of leaf senescence through a [ver mas...]
dc.contributor.authorMoschen, Sebastian
dc.contributor.authorMarino, Johanna
dc.contributor.authorNicosia, Salvador
dc.contributor.authorHiggins, Janet
dc.contributor.authorAlseekh, Saleh
dc.contributor.authorAstigueta, Francisco
dc.contributor.authorBengoa Luoni, Sofia Ailin
dc.contributor.authorRivarola, Maximo Lisandro
dc.contributor.authorFernie, Alisdair R.
dc.contributor.authorBlanchet, Nicolas
dc.contributor.authorLanglade, Nicolas B.
dc.contributor.authorPaniego, Norma Beatriz
dc.contributor.authorFernandez, Paula Del Carmen
dc.contributor.authorHeinz, Ruth Amelia
dc.date.accessioned2019-10-31T11:44:37Z
dc.date.available2019-10-31T11:44:37Z
dc.date.issued2019-10
dc.identifier.issn1471-2229
dc.identifier.otherhttps://doi.org/10.1186/s12870-019-2021-6
dc.identifier.urihttps://bmcplantbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12870-019-2021-6
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.12123/6248
dc.description.abstractBackground: Leaf senescence is a complex process, controlled by multiple genetic and environmental variables. In sunflower, leaf senescence is triggered abruptly following anthesis thereby limiting the capacity of plants to keep their green leaf area during grain filling, which subsequently has a strong impact on crop yield. Recently, we performed a selection of contrasting sunflower inbred lines for the progress of leaf senescence through a physiological, cytological and molecular approach. Here we present a large scale transcriptomic analysis using RNA-seq and its integration with metabolic profiles for two contrasting sunflower inbred lines, R453 and B481–6 (early and delayed senescence respectively), with the aim of identifying metabolic pathways associated to leaf senescence. Results: Gene expression profiles revealed a higher number of differentially expressed genes, as well as, higher expression levels in R453, providing evidence for early activation of the senescence program in this line. Metabolic pathways associated with sugars and nutrient recycling were differentially regulated between the lines. Additionally, we identified transcription factors acting as hubs in the co-expression networks; some previously reported as senescence-associated genes in model species but many are novel candidate genes. Conclusions: Understanding the onset and the progress of the senescence process in crops and the identification of these new candidate genes will likely prove highly useful for different management strategies to mitigate the impact of senescence on crop yield. Functional characterization of candidate genes will help to develop molecular tools for biotechnological applications in breeding crop yield.eng
dc.formatapplication/pdfes_AR
dc.language.isoenges_AR
dc.publisherBMCes_AR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesses_AR
dc.sourceBMC Plant Biology 19 : Article number 446 (October 2019)es_AR
dc.subjectBiotecnologíaes_AR
dc.subjectBiotechnologyeng
dc.subjectHelianthus Annuuses_AR
dc.subjectFenotiposes_AR
dc.subjectPhenotypeseng
dc.subjectAvejentamientoes_AR
dc.subjectSenescenceeng
dc.subjectHojases_AR
dc.subjectLeaveseng
dc.subjectGenéticaes_AR
dc.subjectGeneticseng
dc.subject.otherGirasoles_AR
dc.subject.otherSunflowereng
dc.titleExploring gene networks in two sunflower lines with contrasting leaf senescence phenotype using a system biology approaches_AR
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/artículoes_AR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/articlees_AR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersiones_AR
dc.description.origenEEA Famailláes_AR
dc.description.filFil: Moschen, Sebastian Nicolás. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Marino, Johanna. Universidad Nacional de San Martín. Escuela de Ciencia y Tecnología; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Nicosia, Salvador. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Higgins, Janet. Norwich Research Park. Earlham Institute; Reino Unidoes_AR
dc.description.filFil: Alseekh, Saleh. Max-Planck-Institut für Molekulare Pflanzenphysiologie; Alemaniaes_AR
dc.description.filFil: Astigueta, Francisco. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Bengoa Luoni, Sofia Ailin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto Tecnológico Chascomús. Universidad Nacional de General San Martín. Instituto Tecnológico Chascomús; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Rivarola, Maximo Lisandro. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Fernie, Alisdair R. Max-Planck-Institut für Molekulare Pflanzenphysiologie; Alemaniaes_AR
dc.description.filFil: Blanchet, Nicolas. Université de Toulouse. LIPM-INRA-CNRS; Franciaes_AR
dc.description.filFil: Langlade, Nicolas B. Université de Toulouse. LIPM-INRA-CNRS; Franciaes_AR
dc.description.filFil: Paniego, Norma Beatriz. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Fernandez, Paula Del Carmen. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Heinz, Ruth Amelia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentinaes_AR
dc.subtypecientifico


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