Genetic characterisation of PPARG, CEBPA and RXRA, and their influence on meat quality traits in cattle

Abstract

Antecedentes: peroxisoma receptor gamma activado por el proliferador (PPARg), unión a CCAAT / potenciador de la proteína alfa (CEBPA) y el receptor de retinoides X alfa (RXRA) son factores de transcripción nuclear que desempeñan papeles importantes en regulación de la adipogénesis y la deposición de grasa. Los objetivos de este estudio fueron caracterizar la variabilidad de estos tres genes candidatos en un panel muestra mixta compuestas de varias razas de ganado con diferente calidad de la carne, validar polimorfismos de nucleótido único (SNPs) en una población mestiza local (Angus - Hereford - Limousin) y evaluar sus efectos sobre la calidad de la carne (espesor de grasa dorsal, el contenido de grasa intramuscular y la composición de ácidos grasos), el apoyo a las pruebas de asociación con los estudios de predicción bioinformáticas.

Background: Peroxisome proliferator-activated receptor gamma (PPARG), CCAAT/enhancer binding protein alpha (CEBPA) and retinoid X receptor alpha (RXRA) are nuclear transcription factors that play important roles in regulation of adipogenesis and fat deposition. The objectives of this study were to characterise the variability of these three candidate genes in a mixed sample panel composed of several cattle breeds with different meat quality, validate single nucleotide polymorphisms (SNPs) in a local crossbred population (Angus - Hereford - Limousin) and evaluate their effects on meat quality traits (backfat thickness, intramuscular fat content and fatty acid composition), supporting the association tests with bioinformatic predictive studies.