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resumen

Abstract
Capsicum includes ca. 41 species of chili peppers. In this original report we PCR amplified, cloned, sequenced and characterized the 5S rDNA non-transcribed spacer -NTS- in 23 taxa of nine clades of Capsicum, divergent at geographical origin and fruit and chromosome traits, and compared the NTS features throughout Solanaceae. According to GC content, inner variability and regulatory elements, the NTS organizes into three distinct structural regions; [ver mas...]
 
Capsicum incluye ca. 41 especies de ajíes. En este trabajo original, el espaciador no-transcrito (NTS) del ADNr 5S fue PCR-amplificado, clonado, secuenciado y caracterizado en 23 taxones de nueve clonados de Capsicum, divergentes en origen, fruto y cromosomas, y comparado a lo largo de Solanaceae. El NTS se organiza en tres regiones estructurales distintas de acuerdo a contenido GC, variabilidad y elementos reguladores; la variabilidad genética del NTS en [ver mas...]
 
dc.contributor.authorGrabiele, Mauro
dc.contributor.authorAguilera, Patricia Mabel
dc.contributor.authorDucasse, Daniel Adrian
dc.contributor.authorDebat, Humberto Julio
dc.date.accessioned2022-04-11T10:39:29Z
dc.date.available2022-04-11T10:39:29Z
dc.date.issued2021
dc.identifier.issn0370-6583
dc.identifier.issn2175-7860
dc.identifier.otherhttps://doi.org/10.1590/2175-7860202172071
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.12123/11612
dc.identifier.urihttps://www.scielo.br/j/rod/a/mKbrh6B3GsMRvJj3cf9fVFL/?format=pdf&lang=en
dc.description.abstractCapsicum includes ca. 41 species of chili peppers. In this original report we PCR amplified, cloned, sequenced and characterized the 5S rDNA non-transcribed spacer -NTS- in 23 taxa of nine clades of Capsicum, divergent at geographical origin and fruit and chromosome traits, and compared the NTS features throughout Solanaceae. According to GC content, inner variability and regulatory elements, the NTS organizes into three distinct structural regions; genetic variability at the NTS in Capsicum and related genus clusters into defined taxa hierarchies. Based on the reconstruction of a maximum-likelihood phylogenetic tree and phylogenetic networks, NTS sequences of Capsicum and related taxa grouped into well recognized categories -genus, section, clade, species, variety-. An evolutionary scenario arose from combined genetic and phylogenetic NTS data, in which monophyly and lineage diversification over time of Capsicum are addressed. Our analysis is original to include all domesticated species of Capsicum prevailing in germplasm collections and breeding programs, together with a large group of wild taxa that demanded further genetic characterization. The NTS set up as a double purpose marker in Capsicum, to directly evaluate genetic variability and reconstruct phylogenetic relationships to a broad extent, and constitutes a valuable tool for germplasm characterization and evolutionary studies within Solanaceae.eng
dc.description.abstractCapsicum incluye ca. 41 especies de ajíes. En este trabajo original, el espaciador no-transcrito (NTS) del ADNr 5S fue PCR-amplificado, clonado, secuenciado y caracterizado en 23 taxones de nueve clonados de Capsicum, divergentes en origen, fruto y cromosomas, y comparado a lo largo de Solanaceae. El NTS se organiza en tres regiones estructurales distintas de acuerdo a contenido GC, variabilidad y elementos reguladores; la variabilidad genética del NTS en Capsicum y géneros relacionados se agrupó en categorías taxonómicas definidas. Las secuencias NTS de Capsicum y taxa relacionados también se agruparon en categorías reconocidas -género, sección, clonado, especie, variedad- durante la reconstrucción de un árbol filogenético de máxima-verosimilitud y diversas redes filogenéticas. De la combinación de datos genéticos y filogenéticos del NTS surge un escenario evolutivo que considera monofilia y diversificación de Capsicum a lo largo del tiempo. Nuestro análisis es original al incluir todas las especies domesticadas de Capsicum, mayoritarias en colecciones y programas, además de un amplio número de ajíes silvestres que demandaban mayor caracterización genética. El NTS constituye un marcador de doble propósito en Capsicum, al evaluar directamente variabilidad genética y reconstruir relaciones filogenéticas extensas, además de ser útil a la caracterización de germoplasma y estudios evolutivos en Solanaceae.spa
dc.formatapplication/pdfes_AR
dc.language.isoenges_AR
dc.publisherInstituto de Pesquisas Jardim Botânico do Rio de Janeiroes_AR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesses_AR
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
dc.sourceRodriguésia 72 : e02062019 (2021)es_AR
dc.subjectChillieses_AR
dc.subjectGenetic Variationeng
dc.subjectPhylogenyeng
dc.subjectCapsicum Annuumes_AR
dc.subjectVariación Genéticaes_AR
dc.subjectFilogeniaes_AR
dc.subjectGuindilla
dc.subject.otherChili Pepperseng
dc.subject.otherGenetic Variabilityeng
dc.subject.otherMolecular Double Purpose Markereng
dc.subject.otherRibosomal NTSeng
dc.subject.otherAjíeses_AR
dc.subject.otherVariabilidad Genéticaes_AR
dc.subject.otherMarcador Molecular de Doble Propósitoes_AR
dc.subject.otherNTS Ribosómicoes_AR
dc.titleMolecular characterization of the 5S rDNA non-transcribed spacer and reconstruction of phylogenetic relationships in Capsicumes_AR
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/artículoes_AR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/articlees_AR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersiones_AR
dc.rights.licenseCreative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)
dc.description.origenInstituto de Patología Vegetales_AR
dc.description.filFil: Grabiele, Mauro. Universidad Nacional de Misiones, Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biotecnología Misiones; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Aguilera, Patricia Mabel. Universidad Nacional de Misiones, Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biotecnología Misiones; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Ducasse, Daniel Adrian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Debat, Humberto Julio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentinaes_AR
dc.subtypecientifico


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