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Abstract
Two synthetic bacterial consortia (SC) composed of bacterial strains Sphingobium sp. (AM), Klebsiella aerogenes (B), Pseudomonas sp. (Bc-h and T), Burkholderia sp. (Bk) and Inquilinus limosus (Inq) isolated from a natural phenanthrene (PHN)-degrading consortium (CON) were developed and evaluated as an alternative approach to PHN biodegradation in bioremediation processes. A metabolic network showing the potential role of strains was reconstructed by in [ver mas...]
dc.contributor.authorMacchi, Marianela
dc.contributor.authorFesta, Sabrina
dc.contributor.authorNieto, Esteban
dc.contributor.authorIrazoqui, Jose Matias
dc.contributor.authorVega-Vela, Nelson E.
dc.contributor.authorJunca, Howard
dc.contributor.authorValacco, María Pía
dc.contributor.authorAmadio, Ariel
dc.contributor.authorMorelli, Irma S.
dc.contributor.authorCoppotelli, Bibiana M.
dc.date.accessioned2021-03-08T17:35:55Z
dc.date.available2021-03-08T17:35:55Z
dc.date.issued2021-03
dc.identifier.issn2215-017X
dc.identifier.otherhttps://doi.org/10.1016/j.btre.2021.e00588
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.12123/8839
dc.identifier.urihttps://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2215017X21000047
dc.description.abstractTwo synthetic bacterial consortia (SC) composed of bacterial strains Sphingobium sp. (AM), Klebsiella aerogenes (B), Pseudomonas sp. (Bc-h and T), Burkholderia sp. (Bk) and Inquilinus limosus (Inq) isolated from a natural phenanthrene (PHN)-degrading consortium (CON) were developed and evaluated as an alternative approach to PHN biodegradation in bioremediation processes. A metabolic network showing the potential role of strains was reconstructed by in silico study of the six genomes and classification of dioxygenase enzymes using RHObase and AromaDeg databases. Network analysis suggested that AM and Bk were responsible for PHN initial attack, while Inq, B, T and Bc-h would degrade PHN metabolites. The predicted roles were further confirmed by physiological, RT-qPCR and metaproteomic assays. SC-1 with AM as the sole PHN degrader was the most efficient. The ecological roles inferred in this study can be applied to optimize the design of bacterial consortia and tackle the biodegradation of complex environmental pollutants.eng
dc.formatapplication/pdfes_AR
dc.language.isoenges_AR
dc.publisherElsevieres_AR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccesses_AR
dc.sourceBiotechnology Reports 29 : e00588 (March 2021)es_AR
dc.subjectBacteriaes_AR
dc.subjectGenéticaes_AR
dc.subjectGeneticseng
dc.subjectMetabolismoes_AR
dc.subjectMetabolismeng
dc.subjectGenómicaes_AR
dc.subjectGenomicseng
dc.subjectPseudomonases_AR
dc.titleDesign and evaluation of synthetic bacterial consortia for optimized phenanthrene degradation through the integration of genomics and shotgun proteomicses_AR
dc.typeinfo:ar-repo/semantics/artículoes_AR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/articlees_AR
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersiones_AR
dc.description.origenEEA Rafaelaes_AR
dc.description.filFil: Macchi, Marianela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Festa, Sabrina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Nieto, Esteban. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Irazoqui, Jose Matias. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Rafaela; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.es_AR
dc.description.filFil: Vega-Vela, Nelson E. Pontificia Universidad Javeriana; Colombia. Universidad de Bogotá Jorge Tadeo Lozano; Colombiaes_AR
dc.description.filFil: Junca, Howard. Microbiomas Foundation. Division Ecogenomics & Holobionts. RG Microbial Ecology: Metabolism, Genomics & Evolution; Colombiaes_AR
dc.description.filFil: Valacco, María Pía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. IQUIBICEN. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. IQUIBICEN; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Amadio, Ariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Rafaela; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina.es_AR
dc.description.filFil: Morelli, Irma S. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentina. Comisión de Investigaciones Científicas de la Provincia de Buenos Aires; Argentinaes_AR
dc.description.filFil: Coppotelli, Bibiana M. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentinaes_AR
dc.subtypecientifico


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