Estudio de la resistencia a Sclerotinia sclerotiorum en líneas endocriadas de girasol

Abstract

La podredumbre húmeda del capítulo (PHC), causada por Sclerotinia sclerotiorum, es una de las limitante más importantes para el cultivo del girasol. Este trabajo tuvo como objetivo identificar las regiones del genoma de girasol asociadas a resistencia a PHC a partir de una estrategia de mapeo de QTL sobre una población de líneas recombinantes endocriadas. Se construyó un nuevo mapa genético incorporando marcadores de tipo SNP sobre un mapa existente, se caracterizó el comportamiento fenotípico de la población utilizando infecciones asistidas del patógeno durante cuatro campañas. Se registraron los datos de incidencia, severidad, intensidad y período de incubación. El mapa resultante posee 2823,8 cM y una densidad media de 4,57 cM por loci. Se identificaron 36 QTLs distribuidos en 13 grupos de ligamiento, destacándose dos regiones sobre los GL10 y 15, por su expresión consistente en las diferentes campañas. Los marcadores asociados a estas regiones podrán ser usados por los programas de mejoramiento en el desarrollo de genotipos con mejor desempeño ante el PHC. Asimismo, estos QTL se presentan como candidatos a ser estudiados en profundidad para caracterizar los componentes funcionales responsables de la expresión del fenotipo de interés.

Sclerotinia head rot (SHR) caused by Sclerotinia sclerotiorum is one of the most important limiting factors in sunflower crop. This study aimed to identify regions of the sunflower genome associated with resistance to SHR, in order to support the development of assisted breeding strategies to accelerate the process of creating new genotypes with resistance to this disease. A population of 135 Recombinant Inbred Lines was genotyped using a collection of SNP markers associated to putative stress resistance genes. The new genetic map build has 2823.8 cM and an average density of 4.57 cM loci. We also conducted field evaluations. A total of 36 QTL distributed along 13 linkage groups were identified. The dispersion in the genome of the QTLs identified for the characters confirmed how vast and complex genetic base for sunflower resistance to SHR is. This thesis has deepened the knowledge of these regions and highlights the importance of the contribution of pointed sources in LG 10 and 15, which are presented as candidates to be analyzed in detail to advance in the identification of responsible genes that contribute to understand the complexity of resistance genetic basis.