Analysis of mixed data to select bananas clones (Musa SPP.) to be included in a germplasm bank

Abstract

In an asexually reproducing hybrid such as banana (Musa spp.), the assessment of clones in the short term is limited because replications are frequently unavailable in the proper number. The aim of this work is to propose the Multiple Factor Analysis of Mixed Data (MFAmix) as a tool for establishing objective criteria to identify banana clones that preserve variability for qualitative and quantitative variables. In the long term, the aim is the development of a banana germplasm bank. MFAmix was applied on a population composed of 124 banana clones collected from different farmers’ fields and four controls. Two groups of variables related to the agronomic aptitude of the clones were evaluated, one composed of nine quantitative variables, and the other, composed of three dichotomous qualitative variables. A Selection Index (SI) was built from the MFAmix coordinates in order to rank the clones and select a subset that allows to preserve the existing genetic variability. The first two axes of MFAmix explained a 49.47% of the total data variability. The set of the banana clones was successfully characterized based on quantitative and qualitative variables. In the long term, the creation of a banana germplasm bank should consider the height and diameter of the plant, the rachis bunch weight and the hands weight, and the qualitative variable plant leafiness.

En un híbrido de reproducción asexual como banana (Musa spp.), la evaluación de los clones en el corto plazo es limitada debido a que generalmente no se cuenta con el número adecuado de repeticiones. El objetivo de este trabajo es aplicar la técnica de Análisis Factorial Múltiple de Datos Mixtos (AFMmix) como una herramienta para establecer criterios objetivos de manera de identificar clones de banana que preserven la variabilidad de los caracteres cualitativos y cuantitativos. A largo plazo, el objetivo es desarrollar un banco de germoplasma de banana. Se aplicó el AFMmix a una población de 124 clones de banana recolectados de diferentes campos de productores y cuatro testigos comerciales. Se evaluaron dos grupos de variables relacionadas con la aptitud agronómica de los clones, uno compuesto por nueve caracteres cuantitativos, y el otro, por tres caracteres cualitativos dicotómicos. Se construyó un Índice de Selección (IS) a partir de las coordenadas del AFMmix de manera de ordenar a los clones de banana para seleccionar un subconjunto de ellos que permita conservar la variabilidad genética existente. Los dos primeros ejes del AFMmix explicaron un 49,47% de la variabilidad total de los datos. Se caracterizó satisfactoriamente al conjunto de clones de banana a través de las variables cuantitativas y cualitativas. A largo plazo, en la creación de un banco de germoplasma de banana se debe considerar a la altura y diámetro de la planta, al peso del raquis y peso de las manos, y al carácter cualitativo frondosidad de la planta.