Cereal Circular RNAs (circRNAs): An Overview of the Computational Resources for Identification and Analysis

Abstract

Circular RNAs (circRNAs) are a widespread class of endogenous noncoding RNAs and they have been studied in the past few years, implying important biological functions in all kingdoms of life. Recently, circRNAs have been identified in many plant species, including cereal crops, showing differential expression during stress response and developmental programs, which suggests their role in these process. In the following years, it is expected that insights into the functional roles of circRNAs can be used by cereal scientists and molecular breeders with the aim to develop new strategies for crop improvement. Here, we briefly outline the current knowledge about circRNAs in plants and we also outline available computational resources for their validation and analysis in cereal species.

Los ARN circulares (circRNA) son una clase muy extendida de ARN no codificantes endógenos y se han estudiado en los últimos años, lo que implica importantes funciones biológicas en todos los reinos de la vida. Recientemente, se han identificado circRNAs en muchas especies de plantas, incluidos los cultivos de cereales, que muestran una expresión diferencial durante la respuesta al estrés y los programas de desarrollo, lo que sugiere su papel en estos procesos. En los años siguientes, se espera que los científicos de cereales y los mejoradores moleculares puedan utilizar los conocimientos sobre los roles funcionales de los circRNA con el objetivo de desarrollar nuevas estrategias para la mejora de cultivos. Aquí, describimos brevemente el conocimiento actual sobre circRNAs en plantas y también describimos los recursos computacionales disponibles para su validación y análisis en especies de cereales.