Búsqueda e identificación de marcadores moleculares de resistencia a mastitis bovina

Abstract

La mastitis es considerada la patología que produce mayores pérdidas económicas para la industria láctea en general ya que produce una disminución en la producción, afecta la calidad de la leche, la tasa de preñez, posee altos costos de diagnóstico y tratamiento, y reduce la vida útil del animal en producción. La resistencia a mastitis es un rasgo complejo que depende de componentes genéticos, ambientales y fisiológicos. Las limitaciones de las medidas clásicas de control han llevado a la búsqueda de alternativas para reducir al mínimo el uso de antibióticos, siendo una de ellas la selección de animales naturalmente resistentes. El recuento de células somáticas (RCS) en leche está directamente relacionado con el nivel de inflamación en la ubre. En este trabajo de tesis se usaron dos estrategias: 1) identificar polimorfismos en genes candidatos (seleccionados en base a su función biológica, fisiológica, funcional, o evidencia previa de asociación con la enfermedad) y 2) utilizar un panel de más de 50.000 marcadores de tipo SNP distribuidos uniformemente en el genoma, a fin de identificar regiones cromosómicas asociadas a la variación en el score de células somáticas (SCS), en un estudio de asociación de genoma completo (GWAS, Genome Wide Association Study). Los diferentes análisis se identificaron 8 marcadores significativamente asociados con el SCS. Se confirmó también que el SCS está influenciado por múltiples loci distribuidos por todo el genoma. Estos resultados contribuyen a obtener un mejor conocimiento sobre las regiones genómicas que influyen en el SCS en rodeos lecheros argentinos.

Mastitis is considered to be the pathology that produces the most economic losses for both, the producer and the dairy industry, causing a decrease in production, affecting the quality of milk, the pregnancy rate, and having high costs for diagnosis and treatment as well as reducing the productive life of the animal. Mastitis control programs based on reducing the number of new infections and limiting the duration of existing infections by hygienic practice and using antibiotics has shown mixed efficacy against different pathogens. These limitations promoted the search for alternatives to minimize the use of antibiotics, by stimulating the animal’s defense systems or by selecting animals showing natural resistance to infections. In this thesis two strategies were used: 1) to identify polymorphisms in candidate genes (based on known biological, physiological, or functional relevance to the disease) and 2) use a panel of more than 50,000 SNP markers evenly distributed throughout the bovine genome in order to identify chromosomal regions associated with variation in somatic cell score (SCS) in a Genome Wide Association Study (GWAS). In the association analysis, eight different markers were found significantly associated with the SCS. This analysis confirmed that the SCS is influenced by multiple loci distributed throughout the genome, each contributing a relatively small effect. These results contributed to a better understanding of the genomic regions influencing the SCS in Argentine dairy herds and together with the use of molecular markers may contribute significantly to the design of better selection programs.