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    • Advancements in sunflower multiparental population phenotyping for Verticillium Wilt using UAV-based multispectral imagery 

      Dominguez, Matías; Colombo, Denis Nahuel; Dillchneider Loza, Alexandra; Lavandera, Javier Eduardo; Corro Molas, Andres Ezequiel; Troglia, Carolina Beatriz; Paniego, Norma Beatriz (International Sunflower Association, 2024-08)
      Here we present progress in phenotyping a sunflower Multiparent Advanced Generation Inter-Crosses (MAGIC) population for Verticillium wilt (VW), one of the most important sunflower diseases in Argentina. In addition, the ...

    • Association mapping in sunflower for sclerotinia head rot resistance 

      Fusari, Corina Mariana; Di Rienzo, Julio A.; Troglia, Carolina Beatriz; Nishinakamasu, Veronica; Moreno, Maria Valeria; Maringolo, Carla Andrea; Quiroz, Facundo Jose; Alvarez, Daniel; Escande, Alberto; Hopp, Horacio Esteban; Heinz, Ruth Amelia; Lia, Veronica Viviana; Paniego, Norma Beatriz (BMC, 2012-06)
      Background: Sclerotinia Head Rot (SHR) is one of the most damaging diseases of sunflower in Europe, Argentina, and USA, causing average yield reductions of 10 to 20 %, but leading to total production loss under favorable ...

    • ATGC transcriptomics : a web-based application to integrate, explore and analyze de novo transcriptomic data 

      Gonzalez, Sergio Alberto; Clavijo, Bernardo; Rivarola, Maximo Lisandro; Moreno, Patricio; Fernández, Paula; Dopazo, Joaquín; Paniego, Norma Beatriz (2017-02-22)
      Background: In the last years, applications based on massively parallelized RNA sequencing (RNA-seq) have become valuable approaches for studying non-model species, e.g., without a fully sequenced genome. RNA-seq is a ...

    • Building MAGIC populations : Novel resources for sunflower trait improvement 

      Dominguez, Matías; Colombo, Denis Nahuel; Filippi, Carla Valeria; Ben Guerrero, Emiliano; Dillchneider Loza, Alexandra; Corro Molas, Andres Ezequiel; Montecchia, Juan Francisco; Fass, Monica Irina; Lavandera, Javier Eduardo; Troglia, Carolina Beatriz; Lia, Veronica Viviana; Gonzalez, Julio Horacio; Alvarez, Daniel; Cervigni, Gerardo Domingo Lucio; Paniego, Norma Beatriz (Elsevier, 2025-06)
      Multiparent advanced generation inter-cross (MAGIC) populations improve the accuracy of quantitative trait loci mapping compared to biparental populations by increasing diversity and reducing linkage disequilibrium between ...

    • Caracterización bioquímica de razas nativas de maíz de Argentina en ensayos de jardín común 

      Dudzien, Tatiana L.; Defacio, Raquel Alicia; Paniego, Norma Beatriz; Lia, Verónica V.; Dominguez, Pia Guadalupe (Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), 2024-11)
      En Argentina existen alrededor de 60 razas nativas de maíz (Zea mays ssp. mays), con dos centros principales de diversidad en las regiones andina y chaqueña-mesopotámica. Estas razas nativas presentan una alta diversidad ...

    • Characterisation of maize landraces from Argentina at the phenotypic and biochemical levels 

      Dudzien, Tatiana; Defacio, Raquel Alicia; Paniego, Norma Beatriz; Lia, Veronica Viviana; Dominguez, Pia Guadalupe (Sociedad Argentina de Fisiología Vegetal, 2023-09)
      In Argentina, there are about 60 maize (Zea mays ssp. mays) landraces, with two main diversity centers in the Andean and Mesopotamian-Chaco plain regions. These landraces show high genetic diversity, which makes them a ...

    • Co-expression networks in sunflower : harnessing the power of multi-study transcriptomic public data to identify and categorize candidate genes for fungal resistance 

      Ribone, Andrés Ignacio; Fass, Monica Irinia; Gonzalez, Sergio Alberto; Lia, Veronica Viviana; Paniego, Norma Beatriz; Rivarola, Maximo Lisandro (MDPI, 2023-08)
      Fungal plant diseases are a major threat to food security worldwide. Current efforts to identify and list loci involved in different biological processes are more complicated than originally thought, even when complete ...

    • Combining linkage and association mapping approaches to study the genetic architecture of verticillium wilt resistance in sunflower 

      Montecchia, Juan Francisco; Fass, Monica Irinia; Dominguez, Matías; Gonzalez, Sergio Alberto; Garcia, Martin Nahuel; Filippi, Carla Valeria; Ben Guerrero, Emiliano; Maringolo, Carla Andrea; Troglia, Carolina Beatriz; Quiroz, Facundo Jose; Gonzalez, Julio Horacio; Alvarez, Daniel; Heinz, Ruth; Lia, Veronica Viviana; Paniego, Norma Beatriz (MDPI, 2025-04)
      Sunflower Verticillium Wilt and Leaf Mottle (SVW), caused by Verticillium dahliae Kleb., is a globally prevalent disease affecting sunflower production. In this study, we identified a major quantitative trait locus (QTL) ...

    • Comparison of ddRADseq and EUChip60K SNP genotyping systems for population genetics and genomic selection in Eucalyptus dunnii (Maiden) 

      Aguirre, Natalia Cristina; Villalba, Pamela Victoria; Garcia, Martin Nahuel; Filippi, Carla Valeria; Rivas, Juan Gabriel; Martinez, Maria Carolina; Acuña, Cintia Vanesa; Lopez, Javier Augusto; Lopez, Juan Adolfo; Pathauer, Pablo Santiago; Palazzini, Dino; Harrand, Leonel; Oberschelp, Gustavo Pedro Javier; Marco, Martin Alberto; Cisneros, Esteban F.; Carreras, Rocío; Alves, Ana; Rodrigues, Jose; Hopp, Horacio Esteban; Grattapaglia, Dario; Cappa, Eduardo Pablo; Paniego, Norma Beatriz; Marcucci Poltri, Susana Noemi (Frontiers Media, 2024-03)
      Eucalyptus dunnii is one of the most important Eucalyptus species for short-fiber pulp production in regions where other species of the genus are affected by poor soil and climatic conditions. In this context, E. dunnii ...

    • Comprehensive Analysis of the Influence of Technical and Biological Variations on De Novo Assembly of RNA-Seq Datasets 

      Gonzalez, Sergio Alberto; Rivarola, Maximo Lisandro; Ribone, Andrés Ignacio; Lew, Sergio Eduardo; Paniego, Norma Beatriz (Sage Publications, 2024-12)
      De novo assembly of transcriptomes from species without reference genome remains a common problem in functional genomics. While methods and algorithms for transcriptome assembly are continually being developed and published, ...

    • ddRADseq‑mediated detection of genetic variants in sugarcane 

      Molina, Catalina; Aguirre, Natalia Cristina; Vera, Pablo Alfredo; Filippi, Carla Valeria; Puebla, Andrea Fabiana; Marcucci Poltri, Susana Noemi; Paniego, Norma Beatriz; Acevedo, Alberto (Springer, 2022-11-11)
      Sugarcane (Saccharum sp.), a world-wide known feedstock for sugar production, bioethanol, and energy, has an extremely complex genome, being highly polyploid and aneuploid. A double-digestion restriction site-associated ...

    • De novo assembly and characterization of leaf transcriptome for the development of functional molecular markers of the extremophile multipurpose tree species Prosopis alba 

      Torales, Susana Leonor; Rivarola, Maximo Lisandro; Pomponio, Maria Florencia; Gonzalez, Sergio Alberto; Acuña, Cintia Vanesa; Fernandez, Paula Del Carmen; Lopez Lauenstein, Diego; Verga, Anibal; Hopp, Horacio Esteban; Paniego, Norma Beatriz; Marcucci Poltri, Susana Noemi (2013-10)
      Background: Prosopis alba (Fabaceae) is an important native tree adapted to arid and semiarid regions of north-western Argentina which is of great value as multipurpose species. Despite its importance, the genomic resources ...

    • De novo transcriptome sequencing and SSR markers development for Cedrela balansae C.DC., a native tree species of northwest Argentina 

      Torales, Susana Leonor; Rivarola, Maximo Lisandro; Gonzalez, Sergio Alberto; Inza, Maria Virginia; Pomponio, Maria Florencia; Fernandez, Paula Del Carmen; Acuña, Cintia Vanesa; Zelener, Noga; Fornes, Luis Fernando; Hopp, Horacio Esteban; Paniego, Norma Beatriz; Marcucci Poltri, Susana Noemi (Plos One, 2018-12)
      The endangered Cedrela balansae C.DC. (Meliaceae) is a high-value timber species with great potential for forest plantations that inhabits the tropical forests in Northwestern Argentina.Research on this species is scarce ...

    • Desarrollo de poblaciones multiparentales como fuente de nuevos recursos genéticos para el mejoramiento de girasol 

      Dominguez, Matías (Facultad de Ciencias Agrarias, Universidad Nacional de Rosario, 2022-12)
      El área de cultivo de girasol en Argentina, se extiende entre los 24 y 38 grados de latitud sur, abarcando una amplia gama de ambientes. La plasticidad del cultivo en su adaptación a diversas condiciones agroecológicas lo ...

    • Desarrollo de poblaciones mutagenizadas en girasol 

      Fass, Monica Irinia; Conte, Mariana; Puebla, Andrea Fabiana; Nishinakamasu, Veronica; Ben Guerrero, Emiliano; Landau, Alejandra Mabel; Dominguez, Matías; Gonzalez, Sergio Alberto; Alvarez, Daniel; Lia, Verónica Viviana; Paniego, Norma Beatriz (Asociación Argentina de Girasol, 2024-05)
      Desde hace unos años el grupo de girasol del INTA ha incorporado poblaciones mutagenizadas como herramienta de suministro de nueva variabilidad y de aplicación de genética reversa y directa. Dada la importancia de contar ...

    • Desarrollo de una metodología de extracción de conocimientos a partir de datos de micromatrices de DNA basada en ontologías genéticas 

      Taie, Armando (Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, 2008-12)
      Los experimentos de micromatrices de DNA permiten obtener información sobre la expresión conjunta de cientos o miles de genes, lo que ha producido un importante incremento en el volumen de datos disponibles en el área de ...

    • Desarrollo de una población multiparental como fuente de nuevos recursos genéticos para el mejoramiento de girasol 

      Dominguez, Matías; Filippi, Carla Valeria; Montecchia, Juan Francisco; Fass, Monica Irina; Palifermo, F.N.; Quiroz, Facundo Jose; Alvarez, Daniel; Heinz, Ruth Amelia; Gonzalez, Julio Horacio; Paniego, Norma Beatriz (Asociación Argentina de Girasol (ASAGIR), 2019-07)
      En este trabajo se presentan avances del desarrollo de una población multi-parental (PMP) de tipo MAGIC (Multiple Advanced Generation Intercrosses) en el contexto del programa de mejoramiento de girasol de INTA para ...

    • Development, characterization and experimental validation of a cultivated sunflower (Helianthus annuus L.) gene expression oligonucleotide microarray 

      Fernandez, Paula Del Carmen; Soria, Marcelo Abel; Blesa, David; Di Rienzo, Julio A.; Moschen, Sebastian Nicolas; Rivarola, Maximo Lisandro; Clavijo, Bernardo; Gonzalez, Sergio; Peluffo, Lucila; Principi, Dario; Dosio, Guillermo; Aguirrezabal, Luis; García-García, Francisco; Conesa, Ana; Hopp, Horacio Esteban; Dopazo, Joaquín; Heinz, Ruth Amelia; Paniego, Norma Beatriz (PLOS One, 2012-10)
      Oligonucleotide-based microarrays with accurate gene coverage represent a key strategy for transcriptional studies in orphan species such as sunflower, H. annuus L., which lacks full genome sequences. The goal of this study ...

    • Diversidad genética en girasol cultivado: análisis de una colección de germoplasma local para su aplicación en programas de mejoramiento 

      Moreno, Maria Valeria (Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, 2010)
      Los bancos de semillas ofrecen una valiosa fuente de diversidad para el mejoramiento genético de los cultivos. Para un aprovechamiento óptimo de los recursos genéticos, la caracterización fenotípica de los materiales ...

    • Diversidad genómica y mapeo por asociación para la resistencia a la podredumbre húmeda del capítulo causada por Sclerotinia sclerotiorum en girasol 

      Filippi, Carla Valeria (Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, 2015)
      Argentina tiene una larga tradición en el mejoramiento de girasol, siendo su germoplasma un recurso genético invaluable a nivel mundial. Nuestro país es el tercer exportador mundial de aceite crudo y segundo exportador de ...