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Agroinoculation of a full-length cDNA clone of cotton leafroll dwarf virus (CLRDV) results in systemic infection in cotton and the model plant Nicotiana benthamiana
Delfosse, Veronica Cecilia; Casse, Maria Florencia; Agrofoglio, Yamila Carla; Bonacic Kresic, Iván; Hopp, Horacio Esteban; Ziegler-Graff, Véronique; Distefano, Ana Julia (2013-07)Cotton blue disease is the most important viral disease of cotton in the southern part of South America. Its etiological agent, cotton leafroll dwarf virus (CLRDV), is specifically transmitted to host plants by the aphid ... -
Análisis de redes de coexpresión de la enfermedad cítrica Huanglongbing a partir de estudios de cinética de infección
Machado, Rodrigo; Moschen, Sergio; Gonzalez, Santiago Geronimo; Conti, Gabriela; Di Rienzo, Julio Alejandro; Burdyn, Lourdes; Hopp, Horacio Esteban; Fernandez, Paula Del Carmen (Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires ( UNNOBA), 2022-10)HuangLongBing (HLB) es la enfermedad más devastadora de los cítricos y hasta el momento no cuenta con un tratamiento efectivo. Es causada por bacterias del género Candidatus Liberibacter spp. Estas bacterias son parásitos ... -
Análisis del microbioma de insectos: identificación y caracterización de glicosil hidrolasas
Ben Guerrero, Emiliano (Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, 2018)Algunos insectos han desarrollado estrategias muy eficaces para utilizar sustratos lignocelulósicos como fuentes de energía. En termitas y algunos coleópteros, la digestión de la lignocelulosa es el resultado de la acción ... -
Association mapping in sunflower for sclerotinia head rot resistance
Fusari, Corina Mariana; Di Rienzo, Julio A.; Troglia, Carolina Beatriz; Nishinakamasu, Veronica; Moreno, Maria Valeria; Maringolo, Carla Andrea; Quiroz, Facundo Jose; Alvarez, Daniel; Escande, Alberto; Hopp, Horacio Esteban; Heinz, Ruth Amelia; Lia, Veronica Viviana; Paniego, Norma Beatriz (BMC, 2012-06)Background: Sclerotinia Head Rot (SHR) is one of the most damaging diseases of sunflower in Europe, Argentina, and USA, causing average yield reductions of 10 to 20 %, but leading to total production loss under favorable ... -
Biotechnological improvement of ornamental plants
Darqui, Flavia Soledad; Radonic, Laura Mabel; Hopp, Horacio Esteban; Lopez Bilbao, Marisa Gisela (2017)The discovery of commercial transgenic varieties of orange petunias sold in Europe and the United States although they had never reached the approved status, and the consequent recommendation to destroy them, was the trigger ... -
Búsqueda de genes candidatos que controlen QTLs involucrados en la resistencia al estrés hídrico mediante el análisis de perfiles transcripcionales en especies silvestres de Solanum
Lucca, Ana Maria Florencia (Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, 2013-03)La papa (Solanum tuberosum ssp. tuberosum) es el tercer cultivo más importante y la dicotiledónea de mayor importancia en la alimentación. El estrés hídrico es la mayor limitante de la producción. En respuesta a la sequía ... -
Caracterización molecular de mutantes derivadas del genotipo mutador de cloroplastos de cebada
Colombo, Noemi (Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, 2008)La coordinación de la expresión génica entre los genomas nuclear, plastídico y mitocondrial es de importancia crucial para las células vegetales. Un caso particular de la interacción núcleo-plástido está dado por los genes ... -
Caracterización molecular y cariotípica de la variabilidad genética de germoplasma argentino de Solanum L.
Marcucci Poltri, Susana Noemi (Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, 1998)La papa cultivada se encuentra relacionada con un gran número de especies del género Solanum con las que frecuentemente se cruza. Por tal motivo, las aproximadamente 200 especies silvestres que producen tuberculo, constituyen ... -
Characterization of genetic diversity in accessions of prunus salicina lindl : keeping fruit flesh color ideotype while adapting to water stressed environments
Acuña, Cintia Vanesa; Rivas, Juan Gabriel; Brambilla, Silvina Maricel; Cerrillo, Teresa; Frusso, Enrique; Garcia, Martin Nahuel; Villalba, Pamela Victoria; Aguirre, Natalia Cristina; Sabio Y Garcia, Julia Veronica; Martinez, Maria Carolina; Hopp, Horacio Esteban; Marcucci Poltri, Susana Noemi (MDPI, 2019-08)The genetic diversity of 14 Japanese plum (Prunus salicina Lindl) landraces adapted to an ecosystem of alternating flooding and dry conditions was characterized using neutral simple sequence repeat (SSR) markers. Twelve ... -
Citrus genetic transformation: an overview of the current strategies and insights on the new emerging technologies
Conti, Gabriela; Xoconostle-Cázares, Beatriz; Marcelino-Pérez, Gabriel; Hopp, Horacio Esteban; Reyes Martinez, Carina Andrea (Frontiers Media, 2021-11)Citrus are among the most prevailing fruit crops produced worldwide. The implementation of effective and reliable breeding programs is essential for coping with the increasing demands of satisfactory yield and quality of ... -
Comparison of ddRADseq and EUChip60K SNP genotyping systems for population genetics and genomic selection in Eucalyptus dunnii (Maiden)
Aguirre, Natalia Cristina; Villalba, Pamela Victoria; Garcia, Martin Nahuel; Filippi, Carla Valeria; Rivas, Juan Gabriel; Martinez, Maria Carolina; Acuña, Cintia Vanesa; Lopez, Javier Augusto; Lopez, Juan Adolfo; Pathauer, Pablo Santiago; Palazzini, Dino; Harrand, Leonel; Oberschelp, Gustavo Pedro Javier; Marco, Martin Alberto; Cisneros, Esteban F.; Carreras, Rocío; Alves, Ana; Rodrigues, Jose; Hopp, Horacio Esteban; Grattapaglia, Dario; Cappa, Eduardo Pablo; Paniego, Norma Beatriz; Marcucci Poltri, Susana Noemi (Frontiers Media, 2024-03)Eucalyptus dunnii is one of the most important Eucalyptus species for short-fiber pulp production in regions where other species of the genus are affected by poor soil and climatic conditions. In this context, E. dunnii ... -
De novo assembly and characterization of leaf transcriptome for the development of functional molecular markers of the extremophile multipurpose tree species Prosopis alba
Torales, Susana Leonor; Rivarola, Maximo Lisandro; Pomponio, Maria Florencia; Gonzalez, Sergio Alberto; Acuña, Cintia Vanesa; Fernandez, Paula Del Carmen; Lopez Lauenstein, Diego; Verga, Anibal; Hopp, Horacio Esteban; Paniego, Norma Beatriz; Marcucci Poltri, Susana Noemi (2013-10)Background: Prosopis alba (Fabaceae) is an important native tree adapted to arid and semiarid regions of north-western Argentina which is of great value as multipurpose species. Despite its importance, the genomic resources ... -
De novo transcriptome sequencing and SSR markers development for Cedrela balansae C.DC., a native tree species of northwest Argentina
Torales, Susana Leonor; Rivarola, Maximo Lisandro; Gonzalez, Sergio Alberto; Inza, Maria Virginia; Pomponio, Maria Florencia; Fernandez, Paula Del Carmen; Acuña, Cintia Vanesa; Zelener, Noga; Fornes, Luis Fernando; Hopp, Horacio Esteban; Paniego, Norma Beatriz; Marcucci Poltri, Susana Noemi (Plos One, 2018-12)The endangered Cedrela balansae C.DC. (Meliaceae) is a high-value timber species with great potential for forest plantations that inhabits the tropical forests in Northwestern Argentina.Research on this species is scarce ... -
Desarrollo de marcadores funcionales y evaluación de la diversidad genética en Eucalyptus globulus con énfasis en genes potencialmente involucrados en características de calidad de la madera
Acuña, Cintia Vanesa (Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, 2011)Eucalyptus globulus es la especie forestal con mejor aptitud papelera y para la obtención de bioenergía a partir de celulosa, mayormente plantada en regiones templadas del mundo. Los proyectos genómicos en Eucalyptus han ... -
Development, characterization and experimental validation of a cultivated sunflower (Helianthus annuus L.) gene expression oligonucleotide microarray
Fernandez, Paula Del Carmen; Soria, Marcelo Abel; Blesa, David; Di Rienzo, Julio A.; Moschen, Sebastian Nicolas; Rivarola, Maximo Lisandro; Clavijo, Bernardo; Gonzalez, Sergio; Peluffo, Lucila; Principi, Dario; Dosio, Guillermo; Aguirrezabal, Luis; García-García, Francisco; Conesa, Ana; Hopp, Horacio Esteban; Dopazo, Joaquín; Heinz, Ruth Amelia; Paniego, Norma Beatriz (PLOS One, 2012-10)Oligonucleotide-based microarrays with accurate gene coverage represent a key strategy for transcriptional studies in orphan species such as sunflower, H. annuus L., which lacks full genome sequences. The goal of this study ... -
Editorial : Plant transformation
Hopp, Horacio Esteban; Spangenberg, German; Herrera-Estrella, Luis (Frontiers Media, 2022-04)Plant transformation provides a key tool for much basic research, such as the study of gene functions and interactions, protein–protein interactions, developmental processes, as well as applications for crop improvement ... -
Estudio de diversidad y estructura genética de procedencias locales de Eucalyptus sideroxylon (A.Cunn.ex Woolls) del norte de la provincia de Buenos Aires (Argentina)
Rivas, Juan Gabriel; Pathauer, Pablo Santiago; Aguirre, Natalia Cristina; Villalba, Pamela Victoria; Garcia, Martin Nahuel; Palazzini, Dino; Cappa, Eduardo Pablo; Acuña, Cintia Vanesa; Hopp, Horacio Esteban; Martinez, Maria Carolina; Marcucci Poltri, Susana Noemi (Red Argentina de Ciencia y Tecnología Forestal, 2023-03)Introducción: Eucalyptus sideroxylon (A.Cunn. ex Woolls) posee una amplia distribución natural, tolera bien las heladas, sequias y suelos pobres, pudiendo crecer en ambientes con 400 mm de precipitación anual (Boland et ... -
Exploring sunflower responses to Sclerotinia head rot at early stages of infection using RNA‑seq analysis
Fass, Monica Irina; Rivarola, Maximo Lisandro; Ehrenbolger, Guillermo Federico; Maringolo, Carla Andrea; Montecchia, Juan Francisco; Quiroz, Facundo Jose; García‑García, Francisco; Dopazo Blázquez, Joaquín; Hopp, Horacio Esteban; Heinz, Ruth Amelia; Paniego, Norma Beatriz; Lia, Veronica Viviana (Springer Nature, 2020-08)Sclerotinia head rot (SHR), caused by the necrotrophic fungus Sclerotinia sclerotiorum, is one of the most devastating sunflower crop diseases. Despite its worldwide occurrence, the genetic determinants of plant resistance ... -
Functional and biochemical properties of Mal de Río Cuarto virus (Fijivirus, Reoviridae) P9-1 viroplasm protein show further similarities to animal reovirus counterparts
Maroniche, Guillermo Andrés; Mongelli, Vanesa Claudia; Peralta, Andrea Veronica; Distefano, Ana Julia; Llauger, Gabriela; Taboga, Oscar Alberto; Hopp, Horacio Esteban; Del Vas, Mariana (Elsevier, 2010-09)Mal de Río Cuarto virus (MRCV) is a plant virus of the genus Fijivirus within the family Reoviridae that infects several monocotyledonous species and is transmitted by planthoppers in a persistent and propagative manner. ... -
Generación de una herramienta para la búsqueda de metadata asociada a transcriptos
Machado, Rodrigo; Moschen, Sebastian Nicolas; Gonzalez, Sergio Alberto; Conti, Gabriela; Massaro, Mora; Di Rienzo, Julio Alejandro; Burdyn, Lourdes; Hopp, Horacio Esteban; Fernandez, Paula Del Carmen (Sociedad Argentina de Informática (SADIO), 2021-10)Al analizar un transcriptoma en primera instancia se debe realizar un pre-procesamiento computacional de las lecturas de transcriptos generados por secuenciadores masivos y posterior obtención de la expresión diferencial ...